SFM 2023

SP6 - Antimicrobiens

Antimicrobial resistance and virulence

Antibiotic resistance and virulence in bacteria interact either synergistically or also with some antagonism. Understanding this interplay is essential in infection management. In this session, we will cover all aspects of antibiotic resistance / virulence interactions from epidemiology and evolution to their mechanistic characterization.

SP12 - Antimicrobiens

Peptides antimicrobiens : diversité, multifonction et potentiel de valorisation

We welcome abstracts presenting recent advances in antimicrobial peptides research, including but not limited to discovery of novel antimicrobial peptides, investigation of their mechanism of action, identification of novel functions and studies related to their engineering, production and applications.

SP20 - Antimicrobiens / Microbiote

Microbiote et antibiorésistance

Relations mutuelles entre Microbiote intestinal et résistance aux antibiotiques. Dans cette session, nous aborderons les interactions qui existent entre la diversité du microbiote intestinal, l’emergence de la résistance aux antibiotiques et les traitements antibiotiques (contenu en gènes de résistance, en plasmides, en bactéries multirésistantes, impact es traitements).

SP26 - T - Antimicrobiens / Mycologie - Parasitologie / Virologie

Nouvelles thérapeutiques anti-infectieuses (bactéries, virus, champignons, parasites)

Dans cette session pourront être présentés toutes les nouvelles stratégies et les nouveaux outils développés pour contrer les résistances bactériennes, virales, fongiques, ou parasitaires.

SP23 - Biodiversité et évolution

Biodiversity & Evolution

The rapid development of –omics technologies and the power of interdisciplinary approaches have dramatically changed the way we study the diversity and evolution of microbial life.
In this session, we will discuss how microbes interact and evolve both at short and long time scales, and how such interactions shape community structure and function.
We welcome abstracts proposing novel concepts, developing new methodologies, or presenting biological advances.

SP24 - Biotechnologies microbiennes

Interêt de la CMF en Biotechnologies microbiennes

2 communications orales seront sélectionnées sur résumés, concernant tout travail mettant en œuvre de la cytométrie pour sélectionner des souches, les quantifier, caractériser leur état physiologique en vue de comprendre et maîtriser les procédés de production de microorganismes ou de métabolites.

SP30 - Biotechnologies microbiennes

Production de métabolites par fermentation

2 communications orales seront sélectionnées sur résumés. Les résumés pourront porter sur la production de métabolites par culture pure, co-culture ou culture mixte pour tout type de substrat et domaine d’application (biotechnologie industrielle, médicale, alimentaire, environnementale,…). De même, les travaux peuvent porter aussi bien sur la compréhension fondamentale des mécanismes fermentaires que sur un développement à visée applicative.

SP36 - Biotechnologies microbiennes

Exploiter les microorganismes pour accélérer le bouclage des cycles : de la capture du CO₂ à la production de biomolécules

4 présentations orales seront sélectionnées sur les processus et procédés Biotech qui favorisent le bouclage des cycles du carbone et des nutriments (N, P, S, etc) depuis leur captage dans l’environnement pour la production de molécules jusqu’à la minéralisation des produits, quel que soit le micro-organisme (bactéries, champignons, microalgues) en souche pure ou en communauté microbienne complexe.

SP4 - Environnement / One Health

Milieux aquatiques et pathogènes hydriques

L’étude et la description des microorganismes dans l’environnement aquatique ainsi et ceux issus de la contamination par les rejets anthropisés est un axe important de la microbiologie environnementale. Les outils récents ont permis de mieux comprendre la dynamique de cette qualité et de mieux appréhender la relation entre eau et santé.

SP10 - Environnement

Exploring the microbial diversity in the environment / Explorer la diversité microbienne dans l’environnement

How to decipher the diversity and the functional role of the microbial communities, as well as the not-well known metabolic functions, by combining innovative approaches.
Comment appréhender le rôle fonctionnel, des métabolismes parfois encore inconnus et la diversité de tous les microorganismes dans les écosystèmes en combinant des approches innovantes en microbiologie.

SP18 - Environnement

Interactions microbiennes dans l’environnement

Depuis quelques années, les multiples et complexes interactions microbiennes, qu’elles soient positives, négatives, adaptatives et coopératives, sont au cœur de nombreux travaux de recherche afin de comprendre les relations intra-espèces, intra-domaines, mais également avec leur environnement. Ainsi, émergent de nouveaux aspects des interactions, de l’holobionte à l’hologénome.

SP35-T - Épidémiologie et génomique des populations / Biodiversité et évolution

Exploration du vivant au service de l’épidémiologie

The world of microbial life and its diversity is a formidable adventure that it is useful to explore and to know how to explore in order to understand the epidemiological forces behind it. Two speakers have been invited to present their work on the dissemination of resistance plasmids or multi-resistant bacteria in a healthcare environment. In this session, work related to the use of innovative technologies or approaches in epidemiological investigations will be considered/discussed with the greatest interest.

SP29 - Innovations pédagogiques

Réflexivité et innovations en Pédagogie

Cette session a pour but de présenter vos retours d’expérience de toute initiative pédagogique en Microbiologie que vous réalisez dans vos enseignements ainsi que des travaux en recherche de l’éducation (étude de l’impact de nouveaux outils sur les connaissances, sondages sur des questions de pédagogie…).

SP5 - Microbiologie clinique

Émergences, réémergences épidémiques

La COVID-19 a fortement impacté nos vies, nos habitudes et nos expositions aux pathogènes. Quelles conséquences la COVID-19 a sur l’épidémiologie des pathogènes ?

SP11 - Microbiologie clinique / Microbiote

Modulation des microbiotes

Cette session sera l’occasion de faire le point sur les différentes stratégies permettant de moduler les interactions hôte-microbiotes (intestinal et autres) à des fins médicales. Quatre résumés sélectionnés pour communication orale compléteront une « keynote » introductive présentant l’état de l’art scientifique et réglementaire sur les bactéries bénéfiques.

SP19 - Microbiologie clinique

Quoi de neuf dans le tube digestif ?

Laissez vous tenter par une bonne part de STEC, une bouchée de Campylobacter, et quelques Norovirus en dessert !
Participez à cette session, vous en saurez un peu plus sur l’évolution de l’épidémiologie et des méthodes diagnostiques des infections digestives humaines.

SP25 - Microbiologie clinique

Le destin des maladies infectieuses humaines et animales : éradication et ré-émergence

Venez (re)découvrir deux maladies infectieuses, la diphtérie et la poliomyélite, souvent négligées dans les enseignements car rares en France aujourd'hui grâce à la prévention vaccinale. Quelle est la situation actuelle de ces deux maladies (sur le plan épidémiologique, clinique, microbiologique, thérapeutique..) ? Pourquoi n'ont-elles pas été éradiquées, peut-on l'espérer pour l'avenir ? Y a t il un risque de re-émergence en France ?

SP31 - T - Microbiologie clinique / Antimicrobiens

Innovation diagnostique : méthodes basées sur l’analyse de cellules uniques (antibiogramme)

Cette session a vocation à faire le point sur l’actualité en terme d’innovation diagnostique. Tout travail portant sur une innovation diagnostique, que ce soit en terme de développement de nouvelle méthodologie ou d’évaluation d’organisation innovante ou de nouvelle méthode est bienvenu et sera considéré par le comité d’organisation.

SP3 - Microbiologie des aliments

Parasitoses ? C’est (aussi) alimentaire mon cher Watson...

Pour cette session tout travail ayant trait à la microbiologie des aliments (méthodes de détection / évaluation du risque…) en relation avec un parasite zoonotique à transmission alimentaire peut être soumis. Trois abstracts sélectionnés pour communication orale compléteront 2 keynotes courtes (23 min) introductives présentant l’état de l’art scientifique et réglementaire du thème.

SP9 - Microbiologie des aliments

Comment fonctionnaliser les matrices alimentaires grâce aux micro-organismes ? Quels bénéfices et mécanismes ?

Par “fonctionnaliser”, on entend dans cette session couvrir tout type de bénéfices potentiels liés à l’activité des microorganismes : bénéfices sur les qualités sensorielles, sanitaires, nutritionnelles, santé, biopréservation…, dans les aliments fermentés ou non, qu’ils soient destinés à l’alimentation humaine ou animale. Le thème est donc très large.

SP17 - Microbiologie des aliments / One Health

La microbiologie des aliments dans le contexte du « One Health » (santé humaine, animale et environnementale)

Dans cette session, pourront être soumis des travaux relatifs aux zoonoses alimentaires, à l’antibiorésistance et à l’impact du changement climatique sur les dangers biologiques.

SP37 - Modélisation du risque / IA

Modéliser l’impact des antibiotiques sur les dynamiques bactériennes : du patient à la population générale

La modélisation mathématique est devenue un outil central dans la compréhension des mécanismes régissant l'émergence et la transmission des agents infectieux. Cette session portera spécifiquement sur l'apport de la modélisation pour la compréhension de l'impact des antibiotiques sur les dynamiques bactériennes. La session sera composée de deux présentations invitées et de deux contributions sélectionnées, portant sur des aspects épidémiologiques, pharmacologiques ou moléculaires des dynamiques bactériennes, appliquées à des données cliniques ou expérimentales.

SP32 - Mycologie / Parasitologie

Place des agents fongiques dans la pathogénie des infections mixtes : et le champignon dans tout ça ?

« Jamais seuls » : Les microorganismes sont présents dans tous les milieux et vivent le plus souvent en communautés, notamment sous forme de biofilms. Ainsi, champignons et bactéries coexistent en de multiples environnements et forment des communautés dynamiques, diversifiées et interdépendantes. Ces communautés mixtes jouent pourtant un rôle central dans un très grand nombre de pathologies humaines, animales et environnementales.

SP38 - Mycologie / Parasitologie

Métabolisme pariétal et biofilm des champignons

Les champignons se distinguent des autres eucaryotes par l’existence d’une paroi composée en grande partie de polysaccharides à l’interface entre la cellule fongique et l’environnement et/ou l’hôte. La paroi fongique joue un rôle majeur dans la morphologie, la perméabilité cellulaire et la réponse au stress, et des modifications de la composition de la paroi accompagnent leur adaptation au milieu. Dans le cas des champignons pathogènes, la paroi fongique porte des structures de type PAMPs reconnues par le système immunitaire de l’hôte et permet la formation de biofilms. Cette session est donc destinée tout à la fois aux scientifiques, chercheurs et médecins s’intéressant aux aspects métabolique, immunologique et physiopathologique de la paroi fongique.

SP1 - Pathogénie microbienne

Microbial Toxins and Beyond

Toxins are crucial virulence determinants responsible for microbial pathogenicity. Bacterial pathogens produce toxins that damage host cells by a variety of mechanisms, including punching holes in cell membranes or damaging DNA. Bacterial toxins act on key cellular pathways in host cells and thus also provide a remarkable toolbox for dissecting fundamental biological processes. Applied research demonstrates that these seemingly deadly microbial toxins can also be used to improve human health, from treating cancer to creating vaccines.
The session focuses on toxins as friend or foe.

SP7-T - Pathogénie microbienne - Bactériologie / Virologie - Mycologie / Parasitologie

Biogenesis and Biological Functions of Extracellular membrane vesicles

Extracellular vesicles (EVs) are increasingly recognized as important mediators of intercellular and inter-kingdom communication via the transfer of a wide variety of molecular cargoes. EVs are implicated in many pathologies, from infectious diseases to neurodegenerative diseases to cancer. Cells infected with a virus produce EVs that stimulate viral infection. The production of EVs in bacteria is known to be associated with biofilm formation, horizontal gene transfer, toxin release and virulence. This session focuses on EVs produced by archaea, bacteria and eukarya and their role in disease, but also their potential as biomarkers or delivery vehicles for therapeutic actions.

SP15-T - Pathogénie microbienne / Modélisation

Microbial communities: from single cell to ecosystem approaches

We welcome abstracts covering novel aspects of biofilms at all scales, from single cells to complex polymicrobial communities, from specific findings to integrated studies and from basic concepts to applications.

SP21 - Pathogénie microbienne

Innate immunity: the gatekeepers?

Innate immunity is the first line of defence against invading microbes. It relies on different types of cells, such as macrophages and granulocytes, which reside or patrol the blood, tissues and mucosal surfaces. This session, co-organized by the Société Française de Microbiologie (SFM) and the Société Française d’Immunologie (SFI), focuses on the mechanisms of innate immunity in various models ranging from invertebrates to animals and humans, and on the varied and sophisticated strategies employed by pathogens to disarm the host's innate resistance mechanisms.

SP27 - Pathogénie microbienne

Environmental signals during infection

Environmental signals are critical during infection. For instance, oxygen tension is low in infected or inflamed tissues and microenvironments. Hypoxia modulates the immune response, and many pathogens benefit from the weakening of host defense mechanisms by hypoxia. Furthermore, low oxygen tension induces specific virulence factors, metabolic rewiring, dormancy and tolerance to antibiotic treatment in microbial pathogens. This session focuses on the role of oxygen and other environmental signals in immunity to pathogens and in microbial virulence and persistence.

SP2 - Sécurité et Sureté biologiques Parcours Charles Mérieux

Gain de fonction chez les micro-organismes

Les expériences visant à rendre plus dangereux des pathogènes au prétexte d’anticiper leur émergence ou de mieux comprendre leur fonctionnement se multiplient depuis la dernière décennie. Les GOF (Gain of fonction), comme ils sont appelés couramment, soulèvent des questions d’ordre éthique et scientifique. Cette session abordera l’utilisation des GOF dans tous les domaines de la microbiologique (médicale, environnementale, nouvelle technologie …) au regard des bénéfices et des risques en matière de sécurité biologique, de dualité et d’éthique.

SP8 - T - Virologie clinique / Microbiologie clinique

Stratégies antivirales et résistance

Malgré des progrès importants et récents concernant la génomique, la protéomique ou la biologie structurale virale et cellulaire, il persiste encore de très nombreuses infections virales n’ayant ni traitement antiviral, ni vaccin ou pour lesquelles l’émergence d’une résistance antivirale est problématique. A l’instar des thérapeutiques prometteuses développées récemment pour les infections par le virus respiratoire syncytial (RSV), cette session montrera qu’il existe de nombreuses stratégies antivirales encourageantes pour espérer créer de nouveaux antiviraux efficaces.

SP16 - Virologie fondamentale

Host virus interaction

In this session, we will discuss different aspects of the interactions between immunity and virus, with a focus on the mechanisms of intrinsic immunity and viral escape. The submitted works may address these aspects by various approaches, in vitro and/or in vivo.

SP22 - Virologie

Virus aquatiques

Dans cette session, nous aborderons la virologie “comme un poisson dans l’eau” ! Le modèle poisson-zèbre nous révèlera ses potentialités pour appréhender les différentes phases des infections virales, étudier les relations hôtes-pathogènes ou développer de nouvelles cibles thérapeutiques. Une excursion en eau de mer nous démontrera alors le rôle majeur des virus comme régulateurs écologiques de notre planète. Les travaux autour de modèles aquatiques ou en lien avec les infections en milieu aquatique seront les bienvenus.

SP28 - Virologie

NGS et métagénomique

La métagénomique est en plein essor aussi bien en recherche clinique que dans le soin. Des enjeux technologiques persistent et de récents développements offrent de nouvelles perspectives. Au-delà de la détection des agents infectieux, les équilibres et les dynamiques des populations bactériennes, virales et fongiques sont aussi à considérer. Les communications sur la détection des agents infectieux et sur les analyses des interactions entre les différentes populations microbiennes issues de données de métagénomique sont les bienvenues.

SP34 - T - Virologie clinique / Microbiologie clinique

Virologie clinique : physiopathologie et résurgences

De présentation pléiomorphes, les atteintes cutanéo-muqueuses liées aux virus peuvent être bénignes, devenir récurrentes voire s'associer à des complications sévères. Sous une apparente simplicité de diagnostic par une analyse sémiologique précise en cas d’éruptions stéréotypées, ces viroses n’ont pas encore livré tous leurs secrets tant sur la phase éruptive que sur les conséquences à court, moyen et long terme. A l’aide de divers exemples, cette session offrira un panorama large des connaissances acquises sur la physiopathologie de ces infections.

SP33 - Session « Jeunes » combinée

De l’hôpital aux océans : comprendre les enjeux de la gestion de l’eau

Cette session passionnante vous permettra de découvrir les enjeux liés à la gestion de l’eau dans les structures hospitalières et leur impact sur l’environnement et inversement. Vous découvrirez comment optimiser le parcours de l’eau pour une utilisation efficace, pour la sécurité des patients, pour la thérapeutique, et les conséquences en aval sur le microbiote marin. Rejoignez-nous pour en savoir plus sur cette thématique cruciale.