Jeudi 5 octobre - Après-midi
Sessions parallèles
Grand Auditorium - Niv. -2
SYMPOSIUM Moderna
Modérateurs : Samira Fafi Kremer & Jérôme Le Goff
mRNA innovation: a new era for vaccination and patient care
- News on mRNA technology and the pipeline
Arnaud Cheret (Moderna)
- Respiratory viruses in transplant patients: the need for prevention
Pr Jérôme Le Goff (Université Paris Cité - Hôpital Saint-Louis)
- Questions and answers
Salle 3&4 - Niv. -1
SYMPOSIUM Présentation du Programme d’Équipement Prioritaire de Recherche “Systèmes Alimentaires, Microbiome et Santé”, objectifs et actions
Modérateurs : Gérard Lina & Marie-Frédérique Lartigue
SYMPOSIUM Antibiogrammes ciblés
Modérateurs : Gérard Lina & Marie-Frédérique Lartigue
- Antibiogramme ciblé pour les infections urinaires à entérobactérie chez la femme : nouvelles recommandations SPILF/SFM labellisée par la HAS
Frédéric Schramm (CHRU de Strasbourg) & Vanina Meyssonnier (SPILF, Paris)
Changement de salle
Sessions parallèles
Salle 2 - Niv. -1
SP15 - T - Pathogénie microbienne - Modélisation
+-
Microbial communities: from single cell to ecosystem approaches
SP15-T - Pathogénie microbienne / Modélisation
Microbial communities: from single cell to ecosystem approaches
We welcome abstracts covering novel aspects of biofilms at all scales, from single cells to complex polymicrobial communities, from specific findings to integrated studies and from basic concepts to applications.
Chairs: Olivier Dussurget & Charlotte Oriol
- Mechanisms of biofilm formation and functions at single-cell resolution
Knut Drescher (University of Basel, Switzerland)
Selected short oral presentations
- Identification of genes involved in the structure and strength change of Klebsiella pneumoniae biofilm
Ibrahima Dramé (Laboratoire Microorganismes: Génome Environnement, Université Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand, France) - Genomic variations in Mycobacterium tuberculosis from pulmonary and extrapulmonary isolates: Insights into compartmentalization
Charlotte Genestet (Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), Lyon, France) - Metal homeostasis during host cells infection by adherent invasive E.coli
Hosni Nedjar (Centre Interdisciplinaire de Recherche en Biologie (CIRB), Collège de France, Paris, France) - Comparative study of intracellular biofilms formed by clinical Adherent-Invasive E. coli
Emma Bruder (Chromosome dynamics, CIRB, Collège de France, INSERM U1050, CNRS UMR7241, PSL University, Paris, France)
Salle Les Horizons - Niv. 2
SP16 - Virologie fondamentale
+-
Host virus interaction
SP16 - Virologie fondamentale
Host virus interaction
In this session, we will discuss different aspects of the interactions between immunity and virus, with a focus on the mechanisms of intrinsic immunity and viral escape. The submitted works may address these aspects by various approaches, in vitro and/or in vivo.
Chairs: Céline Bressollette-Bodin & Florent Marty
- Intrinsic and innate immune responses against RNA viruses
Caroline Goujon (IRIM, CNRS, Montpellier)
Selected short oral presentations
- APOBEC3G editing in HIV-1 group O genomes
Maria-Alexandra Stoica (Univ. Rouen Normandie, INSERM, DYNAMICURE UMR 1311, CHU Rouen, Department of Virology, National Reference Center of HIV, Rouen, France) - Equine infectious Anemia Virus treatment strategies: targeting the virus or the host?
Cécile Schimmich (PhEED, ANSES Laboratoire de Santé Animale, Goustranville, France) - Viral and human transcriptomic investigation of cerebrospinal fluid specimens from patients with herpes simplex virus and varicella-zoster virus infections of the central nervous system
Sonia Burrel (CHU de Bordeaux, Virologie, Université de Bordeaux, CNRS UMR 5234, MFP Spacvir, Bordeaux, France) - Rôle antiviral du cluster de miRNA C19MC dans les vésicules extracellulaires placentaires lors des infections virales congénitales
Gaëtan Ligat (Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), INSERM UMR1291 - CNRS UMR5051 - Université Toulouse III, CHU Purpan, Toulouse, France)
Salle 3&4 - Niv. -1
SP17 - Microbiologie des aliments / One Health +-
La microbiologie des aliments dans le contexte du « One Health »
(santé humaine, animale et environnementale)
SP17 - Microbiologie des aliments / One Health
La microbiologie des aliments dans le contexte du « One Health » (santé humaine, animale et environnementale)
Dans cette session, pourront être soumis des travaux relatifs aux zoonoses alimentaires, à l’antibiorésistance et à l’impact du changement climatique sur les dangers biologiques.
Modératrices : Pauline Kooh & Caroline Le Maréchal
- Évolution du risque lié à Vibrio parahaemolyticus dans les huîtres lié au réchauffement climatique et stratégies de prévention
Anne Thébault (Anses, Maisons-Alfort)
Communications orales courtes sélectionnées
- Évaluation de la qualité microbiologique des larves de mouches de Hermetia illucens pour l’alimentation humaine et animale : quel est l’impact du substrat ?
Lenaïg Brulé (UMR INRAE 1014 SECALIM, Oniris-INRAE, Nantes, France) - Genetic diversity and soil fitness of Listeria monocytogenes in the pig manure recovery sector
Jean Lagarde (UR OPAALE, INRAE, Rennes, France) - Caractérisation du danger Clostridium perfringens dans les filières bovine, porcine et volaille à l’abattoir
Christina Tran (Unité Staphylococcus, Bacillus et Clostridium, Anses, Maisons-Alfort, France) - Impacts au niveau microbien, immunitaire et physiologique de l’application post-traite d'une souche de bactérie lactique sur la peau du trayon pour la prévention des mammites bovines
Coralie Goetz (STLO, INRAE, Institut Agro Rennes-Angers, Rennes, France) - Devenir de Clostridioides difficile au cours de la méthanisation mésophile agricole
Caroline Le Maréchal (Laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort Unité HQPAP, Anses, Ploufragan, France)
Salle 5&6 - Niv. -1
SP18 - Environnement +-
Interactions microbiennes dans l’environnement
SP18 - Environnement
Interactions microbiennes dans l’environnement
Depuis quelques années, les multiples et complexes interactions microbiennes, qu’elles soient positives, négatives, adaptatives et coopératives, sont au cœur de nombreux travaux de recherche afin de comprendre les relations intra-espèces, intra-domaines, mais également avec leur environnement. Ainsi, émergent de nouveaux aspects des interactions, de l’holobionte à l’hologénome.
Modérateurs : Julie Leloup & Philippe Vandenkoornhuyse
- Holobiont and hologenome as additional level of biological organization: validity and prospects
Philippe Vandenkoornhuyse (UMR ECOBIO, Université Rennes 1, Rennes)
Communications orales courtes sélectionnées
- Études des paramètres intervenant dans la bioremédiation du benzo(a)pyrène par le champignon tellurique Talaromyces helicus en colonne de sol
Salomé Bertone (METIS, Sorbonne Université, Paris, France) - Bioremédiation des PCB par des microorganismes fongiques et bactériens
Thibault Le Gratiet (Laboratoire d’Ecologie Microbienne (LEM), Université Claude Bernard Lyon 1, Villeurbanne, France) - The addition of isolated rhizobacteria and commercial arbuscular mycorrhizal fungi synergistically modifies the microbiome associated with the roots of young vines
Romain Darriaut (Ecobio, Univ. Rennes, CNRS, Rennes, France) - FungiSol: A citizen science project to investigate environmental yeasts in urban soils
Isabelle Ourliac-Garnier (UR1155 - IICiMed, Nantes Université, Nantes, France)
Salle 1 - Niv. -2
SP19 - Microbiologie clinique - Parcours formation continue - Session Qualiopi +-
Quoi de neuf dans le tube digestif ? (en association avec le Col.BVH)
SP19 - Microbiologie clinique
Quoi de neuf dans le tube digestif ?
Laissez vous tenter par une bonne part de STEC, une bouchée de Campylobacter, et quelques Norovirus en dessert !
Participez à cette session, vous en saurez un peu plus sur l’évolution de l’épidémiologie et des méthodes diagnostiques des infections digestives humaines.
Modératrices : Sophie Jarraud & Anne Cady
- Escherichia coli producteur de Shiga toxine : passons le STEC au Grill…
Stéphane Bonacorsi (APHP, Paris) - La détection de pathogènes digestifs dans les selles à l’ère de la biologie moléculaire : quel impact en pratique clinique
Nicolas Benech (CHU, Lyon)
Communications orales courtes sélectionnées
- Analyse métabolomique de l’impact de l’antibiothérapie anténatale dirigée contre le Streptocoque du groupe B sur le microbiote intestinal du nourrisson
Cécile Guyonnet (Laboratoire de Bactériologie, Hôpital Cochin, Paris, France) - Role of the mucin protease Vat in colorectal tumorigenesis of colibactin-producing Escherichia coli
Héloïse Chat (M2ISH / INSERM 1071, Université Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand, France)
Grand Auditorium - Niv. -2
SP20 - Antimicrobiens / Microbiote +-
Microbiote et antibiorésistance
SP20 - Antimicrobiens / Microbiote
Microbiote et antibiorésistance
Relations mutuelles entre Microbiote intestinal et résistance aux antibiotiques. Dans cette session, nous aborderons les interactions qui existent entre la diversité du microbiote intestinal, l’emergence de la résistance aux antibiotiques et les traitements antibiotiques (contenu en gènes de résistance, en plasmides, en bactéries multirésistantes, impact es traitements).
Modérateurs : Mathilde Lescat & Vincent Cattoir
- Le résistome du microbiote intestinal : caractérisation, dynamique et opportunités
Étienne Ruppé (APHP, Paris)
Communications orales courtes sélectionnées
- Diversity and antibiotic resistance of Escherichia coli species within the intestinal microbiota in relation to dietary fiber intake
Maïra Saperas-Ghezali (U1153, Equipe de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle (EREN), INSERM Université Sorbonne Paris Nord and Université Paris Cité, INRAE, CRESS, Bobigny, France) - Élaboration d’une formulation combinant souches probiotiques et extraits végétaux ciblant les souches Escherichia coli adhérents/invasifs (AIEC) associées à la maladie de Crohn
Fanny De Clercq (Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l’Hôte, UMR1071 Inserm/Université Clermont Auvergne - USC INRAE 1382, Clermont-Ferrand, France) - PROMISE, un méta-réseau One Health de lutte contre l’antibiorésistance en France
Yohann Lacotte (RESINFIT, U 1092, Univ. Limoges, Inserm, CHU Limoges, Limoges, France) - ABRomics: an integrated multi-omics platform for antibiotic resistance research and public health
Claudine Médigue (UAR3601, CNRS Institut Français de Bioinformatique, Évry, France) - Diversité et succès écologiques des Escherichia coli ST131 associés à la colonisation de l’hôte
Richard Bonnet (M2ISH, UMR Inserm 1091, Univ. Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand, France)
Grand Foyer & Carré - Niv. -2Pause café - Visite de l’exposition
Grand Foyer & Petit Foyer - Niv. -2 Posters
Grand Foyer & Petit Foyer - Niv. -2 SESSION POSTERS affichés 1 - Numéros impairs
Petit Foyer - Niv. -2 SESSION POSTERS commentés 1
Modérateurs : Valentine Berti & Olivier Dussurget
Pour voir la liste des posters commentés : cliquer ici
Sessions parallèles
Salle 3&4 - Niv. -1
SP21 - Pathogénie microbienne
+-
Innate immunity: the gatekeepers? (in association with SFI)
SP21 - Pathogénie microbienne
Innate immunity: the gatekeepers?
Innate immunity is the first line of defence against invading microbes. It relies on different types of cells, such as macrophages and granulocytes, which reside or patrol the blood, tissues and mucosal surfaces. This session, co-organized by the Société Française de Microbiologie (SFM) and the Société Française d’Immunologie (SFI), focuses on the mechanisms of innate immunity in various models ranging from invertebrates to animals and humans, and on the varied and sophisticated strategies employed by pathogens to disarm the host's innate resistance mechanisms.
Chairs: Olivier Neyrolles & Florent Marty
- Mechanisms of cell deaths in infectious diseases
Étienne Meunier (CNRS/IPBS, Toulouse) - Layers of immunity: Deconstructing the Drosophila effector response
Bruno Lemaitre (EPFL, Lausanne, Suisse)
Selected short oral presentations
- Interaction between Chitinase 3-like 1 (CHI3L1) and bacterial protein ChiA: a decisive step for Crohn’s disease-associated adherent and invasive E. coli to enter within human macrophages
Margot Fargeas (M2iSH, Université Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand, France) - Development of trained immunity and activation of inflammasomes are promising strategies to combat Staphylococcus aureus infection
Nadia Nadejda Berkova (INRAE, Institut Agro, Rennes, France)
Salle Les Horizons - Niv. 2
SP22 - Virologie +-
Virus aquatiques (en association avec la SFV)
SP22 - Virologie
Virus aquatiques
Dans cette session, nous aborderons la virologie “comme un poisson dans l’eau” ! Le modèle poisson-zèbre nous révèlera ses potentialités pour appréhender les différentes phases des infections virales, étudier les relations hôtes-pathogènes ou développer de nouvelles cibles thérapeutiques. Une excursion en eau de mer nous démontrera alors le rôle majeur des virus comme régulateurs écologiques de notre planète. Les travaux autour de modèles aquatiques ou en lien avec les infections en milieu aquatique seront les bienvenus.
Modérateurs : Vincent Thibault & Eloi Verrier
- Les virus dans le cycle du carbone marin
Anne-Claire Baudoux (CNRS, Roscoff) - Itinéraire d’un virus. Enquête en poisson zèbre
Christelle Langevin (INRAe, Jouy-en-Josas)
Communications orales courtes sélectionnées
- L’approche métagénomique basée sur le séquençage d’amplicons révèle la grande diversité génomique des souches de norovirus dans les huîtres contaminées
Joanna Ollivier (RBE/MASAE/LSEM, Ifremer, Nantes, France) - Identification de variants du SARS-CoV-2 par séquençage MiSeq dans les eaux usées de métropoles françaises : Intérêt de l’échantillonnage passif
Françoise Vincent-Hubert (MASAE/LSEM, Ifremer, Nantes, France)
Salle 1 - Niv. -2
SP23 - Biodiversité et évolution
+-
Biodiversity & Evolution
SP23 - Biodiversité et évolution
Biodiversity & Evolution
The rapid development of –omics technologies and the power of interdisciplinary approaches have dramatically changed the way we study the diversity and evolution of microbial life.
In this session, we will discuss how microbes interact and evolve both at short and long time scales, and how such interactions shape community structure and function.
We welcome abstracts proposing novel concepts, developing new methodologies, or presenting biological advances.
Chairs: Olaya Rendueles-Garcia & Cécile Monard
- The soil microbiote under control
Cécile Monard (Université Rennes 1, Rennes)
Selected short oral presentations
- Deciphering the emergence of host adaptation of the most virulent pathogenic Leptospira species
Alexandre Giraud-Gatineau (Biologie des Spirochètes, Institut Pasteur, Paris, France) - Yersinopine: a fight for metals across evolution
Pascal Arnoux (MEM, CEA, BIAM, Saint-Paul-lez-Durance, France) - Functional and evolutionary consequences of capsule swap in Klebsiella pneumoniae
Julie Le Bris (CNRS UMR3525, Microbial Evolutionary Genomics Unit, Institut Pasteur, Paris, France) - Identification, rôles et origine de petits ARN interférents chez le parasite minimaliste Anncaliia algerae
Reginald Florian Akossi (UMR 6023 LMGE Équipe IHP, UMR UCA CNRS, Aubière, France)
Salle 2 - Niv. -1
SP24 - Biotechnologies microbiennes +-
Interêt de la CMF en Biotechnologies microbiennes (en association avec l’AFC)
SP24 - Biotechnologies microbiennes
Interêt de la CMF en Biotechnologies microbiennes
2 communications orales seront sélectionnées sur résumés, concernant tout travail mettant en œuvre de la cytométrie pour sélectionner des souches, les quantifier, caractériser leur état physiologique en vue de comprendre et maîtriser les procédés de production de microorganismes ou de métabolites.
Modératrices : Marielle Bouix & Hélène Velly
- De la constitution de banques de souches jusqu’aux étapes de contrôle de la qualité : utilité de la cytométrie en flux pour les applications portant sur les probiotiques de nouvelle génération issus du microbiote intestinal
Vincent Thomas (Lallemand Heath solutions, Blagnac) - Applications de la cytométrie en flux à l’industrie des vaccins vétérinaires
Jean Reyes (VIRBAC, Nice)
Communications orales courtes sélectionnées
- État redox intracellulaire et métabolisme de Clostridia solvantogènes : l’apport de la cytométrie en flux
Hélène Velly (Département Biotechnologie, IFPEN, Rueil-Malmaison, France) - Observation de modifications morphologiques au sein d’une population d’Escherichia coli productrice de protéines recombinantes grâce à un suivi en ligne par cytométrie en flux
Agnès Hocquellet (CBMN UMR 5248 CNRS, Université de Bordeaux, ENSTBB - Bordeaux INP, Bordeaux, France)
Grand Auditorium - Niv. -2
SP25 - Microbiologie clinique - Parcours formation continue - Session Qualiopi +-
Le destin des maladies infectieuses humaines et animales : éradication et ré-émergence
(en association avec la SPILF)
SP25 - Microbiologie clinique
Le destin des maladies infectieuses humaines et animales : éradication et ré-émergence
Venez (re)découvrir deux maladies infectieuses, la diphtérie et la poliomyélite, souvent négligées dans les enseignements car rares en France aujourd'hui grâce à la prévention vaccinale. Quelle est la situation actuelle de ces deux maladies (sur le plan épidémiologique, clinique, microbiologique, thérapeutique..) ? Pourquoi n'ont-elles pas été éradiquées, peut-on l'espérer pour l'avenir ? Y a t il un risque de re-émergence en France ?
Modérateurs : Valentine Berti & Sylvain Brisse
- Écueils du programme d’éradication polio & déploiement d’un nouveau vaccin antipoliomyélitique oral pour endiguer les épidémies
Maël Bessaud (Institut Pasteur, Paris) - La diphtérie, maladie oubliée, à l’ère de la génomique
Sylvain Brisse (Institut Pasteur, Hôpital Necker-Enfants malades, Paris)
Communications orales courtes sélectionnées
- Évaluation de 11 kits de PCR en temps réel pour le diagnostic direct de la borréliose de Lyme
Emilie Talagrand-Reboul (UR7290, ITI InnoVec, Faculté de Médecine, Université de Strasbourg, Strasbourg, France) - Vaccine safety of a new toxoid-based vaccine against Clostridioides difficile infection in rabbits
Mickaël Riou (UE-1277 Plateforme d'Infectiologie expérimentale, INRAE, Nouzilly, France)
Salle 5&6 - Niv. -1
SP26 - T - Antimicrobiens - Mycologie / Parasitologie - Virologie +-
Nouvelles thérapeutiques anti-infectieuses (bactéries, virus, champignons, parasites)
SP26 - T - Antimicrobiens / Mycologie - Parasitologie / Virologie
Nouvelles thérapeutiques anti-infectieuses (bactéries, virus, champignons, parasites)
Dans cette session pourront être présentés toutes les nouvelles stratégies et les nouveaux outils développés pour contrer les résistances bactériennes, virales, fongiques, ou parasitaires.
Modératrices : Isabelle Broutin & Typhaine Brual
- Outils chimiques pour l’étude de L,D-Transpeptidases impliquées dans la synthèse de la paroi cellulaire des bactéries
Mélanie Etheve-Quelquejeu (Paris)
Communications orales courtes sélectionnées
- Interdisciplinary approach for aptamer-based specific delivery to infectious sites of anti-infective compounds from medieval Arab pharmacopoeia
Chaimae Mezouarhi (UMR7021 Laboratory of Bioimaging and Pathologies, CNRS University of Strasbourg, Ilkirch, France) - Harnessing innovative enzymes to combat phytopathogenic bacteria and fungi
Baptiste Kergaravat (Gene&GreenTK, Marseille, France) - Identification of a squalamine derivative with anti-biofilm properties on Pseudomonas aeruginosa
Anne-Sophie Tareau (CBSA, Université de Rouen, Evreux, France)
La Halle 1 - Niv. 1Cocktail dînatoire
26/09/2023