Vendredi 6 octobre - Matinée
Grand Foyer - Niv. -2Accueil des participants
Sessions parallèles
Salle 3&4 - Niv. -1
SP27 - Pathogénie microbienne
+-
Environmental signals during infection
SP27 - Pathogénie microbienne
Environmental signals during infection
Environmental signals are critical during infection. For instance, oxygen tension is low in infected or inflamed tissues and microenvironments. Hypoxia modulates the immune response, and many pathogens benefit from the weakening of host defense mechanisms by hypoxia. Furthermore, low oxygen tension induces specific virulence factors, metabolic rewiring, dormancy and tolerance to antibiotic treatment in microbial pathogens. This session focuses on the role of oxygen and other environmental signals in immunity to pathogens and in microbial virulence and persistence.
Chairs: Olivier Neyrolles & Reynald Gillet
- Shigella plays with oxygen and neutrophils deal with it
Benoit Marteyn (Institut Pasteur, Paris)
Selected short oral presentations
- The CysK2-dependent cysteine biosynthesis pathway plays a key part in Mycobacterium tuberculosis intracellular survival under hypoxia
Wendy Le Mouëllic (Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale, CNRS, Université de Toulouse, Toulouse, France) - Streptococcus agalactiae and zinc homeostasis
Morgane Melet (ISP équipe BRMF, INRAE, Tours, France) - Unraveling the role of Lsr2 protein in the virulence of smooth and rough morphotypes of Mycobacterium abscessus
Elias Gerges (U1173 Infection et Inflammation, Inserm, Université Paris-Saclay, UVSQ, Montigny-Le-Bretonneux, France) - Role of a regulatory RNA in the intracellular survival of the pathogenic bacterium Staphylococcus aureus
Maëliss Germain (U1230 BRM, Université Rennes 1, Rennes, France)
Salle 5&6 - Niv. -1
SP28 - Virologie +-
NGS et métagénomique
SP28 - Virologie
NGS et métagénomique
La métagénomique est en plein essor aussi bien en recherche clinique que dans le soin. Des enjeux technologiques persistent et de récents développements offrent de nouvelles perspectives. Au-delà de la détection des agents infectieux, les équilibres et les dynamiques des populations bactériennes, virales et fongiques sont aussi à considérer. Les communications sur la détection des agents infectieux et sur les analyses des interactions entre les différentes populations microbiennes issues de données de métagénomique sont les bienvenues.
Modérateurs : Jérôme Le Goff & Juliette Besombes
- Understanding the ecological dynamics of phage-bacteria interactions: from metagenomic to mechanistic approaches
Anne Chevallereau (Institut Cochin, Paris)
Communications orales courtes sélectionnées
- Respiratory virome characterization in a cohort of brain-injured patients during the intensive care unit hospitalization
Simon Bulteau (CR2TI, INSERM UMR 1064, Nantes, France) - Performance of clinical metagenomics in France: an observational prospective study
Jacques Fourgeaud (URP 7328 FETUS, Université Paris Cité, Paris, France) - Caractérisation d’une souche d’herpèsvirus équin à l’aide de la technologie de séquençage longs fragments
Delphine Froger (PhEED, Anses Laboratoire de Santé Animale site de Normandie, Goustranville, France) - Virome associé aux biofilms d’usines de transformation alimentaire
Julie Brassard (Centre de Recherche et de Développement de Saint-Hyacinthe, Agriculture et Agroalimentaire Canada, Saint-Hyacinthe, Canada)
Salle 1 - Niv. -2
SP29 - Innovations pédagogiques +-
Réflexivité et innovations en Pédagogie
SP29 - Innovations pédagogiques
Réflexivité et innovations en Pédagogie
Cette session a pour but de présenter vos retours d’expérience de toute initiative pédagogique en Microbiologie que vous réalisez dans vos enseignements ainsi que des travaux en recherche de l’éducation (étude de l’impact de nouveaux outils sur les connaissances, sondages sur des questions de pédagogie…).
Modérateurs : Mathilde Lescat & Michel Federighi
- Comment étudier l’impact du jeu sérieux sur les connaissances ?
Jérôme Legrix-Pagès (UNICAEN, Caen)
Communications orales courtes sélectionnées
- BiochiMix : et si un jeu permettait de réaliser une Mind Map pour les révisions ?
Anaïs Brosse (UMR1319 Micalis, Université Paris-Saclay, INRAE, AgroParisTech, Institut Micalis, Orsay, France) - Utiliser la gamification pour améliorer l’engagement et les résultats d’apprentissage en microbiologie médicale : L’étude de cas de “BacteriaGame”
Mathilde Lescat (Avicenne, APHP, Bobigny, France) - “Wedding Horror” : Investigation d’une Toxi-Infection Alimentaire Collective (TIAC) en mode immersif
Michel Federighi (HQSA, Ecole Nationale Vétérinaire d’Alfort, Maisons-Alfort, France) - Mise en place d’une évaluation de la progression des internes en stage de bactériologie selon le principe des activités professionnelles confiables (Entrustable Professional activities, EPA)
Hélène Pailhoriès (Laboratoire de Bactériologie, CHU d’Angers, Angers, France) - Révision du programme de microbiologie de 3ème année de Médecine via les Serious Games : preuve de concept
Maud Salmona (Laboratoire de Virologie, Hôpital Saint Louis, APHP, Université Paris-Cité, Paris, France)
Salle 2 - Niv. -1
SP30 - Biotechnologies microbiennes +-
Production de métabolites par fermentation (en association avec la FFBiotech)
SP30 - Biotechnologies microbiennes
Production de métabolites par fermentation
2 communications orales seront sélectionnées sur résumés. Les résumés pourront porter sur la production de métabolites par culture pure, co-culture ou culture mixte pour tout type de substrat et domaine d’application (biotechnologie industrielle, médicale, alimentaire, environnementale,…). De même, les travaux peuvent porter aussi bien sur la compréhension fondamentale des mécanismes fermentaires que sur un développement à visée applicative.
Modérateurs : Théodore Bouchez & Nathalie Gorret
- Production et purification de peptides ou de lipopeptides antimicrobiens d’origine bactérienne : apports du génie métabolique et du génie des procédés pour le développement d’applications industrielles
François Coutte (Polytech, Lille) - Heterologous production of isopropanol by Cupriavidus necator: from strain engineering to optimization of production under heterotrophic and autotrophic culture conditions
Nathalie Gorret (INSA, Toulouse)
Communications orales courtes sélectionnées
- Production of bioactive marine bacterial exopolysaccharides and their low-molecular-weight derivatives
Christine Delbarre-Ladrat (MASAE/EM3B, Ifremer, Nantes, France) - An ecofriendly process to produce secondary metabolites from Nostoc species; application to the biosynthesis of Cryptophycine within photobioreactors
Catherine Dupre (GEPEA, UMR CNRS 6144, Saint-Nazaire, France)
Grand Auditorium - Niv. -2
SP31 - T - Microbiologie clinique - Antimicrobiens
Parcours formation continue - Session Qualiopi +-
Innovation diagnostique
SP31 - T - Microbiologie clinique / Antimicrobiens
Innovation diagnostique : méthodes basées sur l’analyse de cellules uniques (antibiogramme)
Cette session a vocation à faire le point sur l’actualité en terme d’innovation diagnostique. Tout travail portant sur une innovation diagnostique, que ce soit en terme de développement de nouvelle méthodologie ou d’évaluation d’organisation innovante ou de nouvelle méthode est bienvenu et sera considéré par le comité d’organisation.
Modératrices : Brigitte Lamy & Marie-Frédérique Lartigue
- La technologie SMR (Suspended Microchannel Resonator) : de la masse des cellules, bactéries et virus aux applications médicales
Vincent Agache (CEA)
Communications orales courtes sélectionnées
- Efficient bacterial colony Identification through spatio-temporal deep Learning using lens-free microscopy
Paul Paquin (DTBS/L4IV, CEA-LETI, Grenoble, France) - Rapid antibiotic susceptibility testing using FTIR spectroscopy and deuterium isotope probing
Stéphan Pissot (DOPT, CEA-LETI, Grenoble, France) - Optical trapping for nondestructive bacterial membrane characterization at the single-cell scale
Pierre Marcoux (LETI / DTBS, CEA, Grenoble, France) - Dénombrement rapide des banques de mycobactéries à usage pharmaceutique par le suivi de la cinétique de marquage
Marine Schnetterle (Redberry, Illkirch-Graffenstaden, France) - Détermination des CMI aux Antiseptiques en routine clinique et exploration de l’impact de l’exposition aux antiseptiques : application aux Staphylococcaceae isolés de dispositifs intravasculaires
Maxime Pichon (U1070 INSERM PHAR2, Université de Poitiers, Poitiers, France)
Salle Les Horizons - Niv. 2
SP32 - Mycologie / Parasitologie +-
Place des agents fongiques dans la pathogénie des infections mixtes :
et le champignon dans tout ça ? (en association avec la SFMM)
SP32 - Mycologie / Parasitologie
Place des agents fongiques dans la pathogénie des infections mixtes : et le champignon dans tout ça ?
« Jamais seuls » : Les microorganismes sont présents dans tous les milieux et vivent le plus souvent en communautés, notamment sous forme de biofilms. Ainsi, champignons et bactéries coexistent en de multiples environnements et forment des communautés dynamiques, diversifiées et interdépendantes. Ces communautés mixtes jouent pourtant un rôle central dans un très grand nombre de pathologies humaines, animales et environnementales.
Modérateurs : Jean-Pierre Gangneux & Françoise Botterel
- Infections mixtes dans les hémocultures : diagnostic et prise en charge des levures en présence de bactéries
Frédéric Dalle (CHU, Dijon) - Candiduries et infections urinaires bactériennes : quand et comment traiter les levures ?
Françoise Botterel (APHP, Créteil)
Communications orales courtes sélectionnées
- Risque environnemental aspergillaire en période de pandémie COVID-19 : impact des chambres à pression négative
Florian Harel (Laboratoire de parasitologie-mycologie, CHU de Rennes, Rennes, France) - Apports de la PCR duplex Aspergillus spp. / Mucorales pour le diagnostic des co-infections Aspergillus / Mucorales
Sébastien Imbert (Service de Parasitologie-Mycologie, CNR des Aspergilloses Chroniques, CHU de Bordeaux, Inserm U1045, Bordeaux, France)
Grand Foyer & Carré - Niv. -2Pause café - Visite de l’exposition
Grand Foyer & Petit Foyer - Niv. -2 Posters
Grand Foyer & Petit Foyer - Niv. -2 SESSION POSTERS affichés 2 - Numéros pairs
Petit Foyer - Niv. -2 SESSION POSTERS commentés 2
Modérateurs : Olivier Dussurget & Typhaine Brual
Pour voir la liste des posters commentés : cliquer ici
Sessions plénières
Grand Auditorium - Niv. -2SYMPOSIUM MGI-Tech
Modérateurs : Jérôme Le Goff & Geneviève Héry-Arnaud
Décrypter le microbiome intestinale pour développer des approches innovantes pour la santé
Vers une meilleure compréhension du rôle du microbiote intestinal dans la santé et les maladies
Sébastien Fromentin (Microbiome Data Scientist, MétaGenoPolis, Jouy-en-Josas)- Analyse du microbiome intestinal par NGS
Sophie Le Fresne-Languille (Responsable de projets R&D, Biofortis, Nantes)
Conférence plénière
Grand Auditorium - Niv. -2 Next generation chemical imaging
Modérateurs : Théodore Bouchez & Marielle Bouix
- Seeing is understanding: Next generation chemical imaging for super-fast functional analyses of microbiomes
Michæl Wagner (Centre for Microbiology and Environmental Systems Science, Wien, Autriche)
Grand Auditorium - Niv. -2Présentation de la Société Algérienne de Microbiologie Clinique
Wahiba Amhis (SAMiC, Algérie)
Grand Auditorium - Niv. -2Annonce des prix
Grand Foyer & Carré - Niv. -2Déjeuner - Visite de l’exposition
Grand Foyer & Petit Foyer - Niv. -2Posters
26/09/2023