SFM 2022

Session plénière

Auditorium Pasteur - Niv. 1SYMPOSIUM bioMérieux  

Place de l’approche syndromique BioFire dans la prise en charge des infections respiratoires

Modérateur : Frédéric Laurent

• Le point de vue du microbiologiste
  Olivier Dauwalder (CHU de Lyon)
• Le point de vue du clinicien en réanimation pédiatrique
  Guillaume Geslain (CHU Robert Debré, Paris)

Salle Barthez - Niv. 2

SP15 - Microbiologie fondamentale / Pathogénie

Communication between Bacteria in Pathogenesis and Commensalism

Chairs: Eric Oswald & Typhaine Brual

• Genetic bases of bacterial adaptation during the experimental evolution of a plant pathogen into a legume symbiont
  Delphine Capela (INRAe, Toulouse)

Selected short oral presentations

• Disrupting bacterial quorum sensing with enzymes towards bacterial control
  Raphaël Billot (Gene&GreenTK, Marseille, France)
• Single-cell dynamics and persistence of Legionella pneumophila
  Nicolas Personnic (Equipe PERSIST, Centre International de Recherche en Infectiologie, Villeurbanne, France)
• c-di-AMP signaling is required for osmotolerance and bile salt resistance in Clostridioides difficile
  Johann Peltier (ARNCLO, I2BC, Gif-Sur-Yvette, France)
• Characterization of the molecular determinants and the consequences of intra and inter-species interactions of the atypical diderm Firmicute Veillonella parvula
  Louis Dorison (UMR6047 / Genetic of Biofilms, Institut Pasteur, Paris, France)

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Salle Sully 1 - Niv. 1

SP16 - Virologie

Stratégies antivirales : cibles cellulaires, antiviraux directs, anticorps monoclonaux

Modératrices : Sonia Burrel & Valentine Berti

• Polymérases, Methyltransférases et Exonucléases : les avantages d’un ménage à trois chez les virus à ARN
  Bruno Canard (AFMB Aix-Marseille, Marseille)

Communications orales courtes sélectionnées

• Inhibiteurs du transport membranaire cellulaire contre les virus respiratoires
  Adrien Le Rouzic (Unité de Virologie et Immunologie Moléculaires (VIM), INRAe, Jouy-en-Josas, France)
• Serum neutralization of SARS-CoV-2 Omicron BA.1, BA.2 and BA.5 in patients receiving monoclonal antibodies
  Timothée Bruel (Institut Pasteur, Paris, France)
• Des cribles CRISPR bidirectionnels à l’échelle du génome révèlent de nouveaux facteurs de l’hôte régulant la réplication de SARS-CoV-2, MERS-CoV et des coronavirus saisonniers HCoVs
  Antoine Rebendenne (Institut de Recherche en Infectiologie de Montpellier, Montpellier, France)
• Antiretroviral drugs effect against Equine Infectious Anemia Virus
  Cécile Schimmich (Laboratoire de Santé Animale, Unité PhEED, ANSES, Goustranville, France)

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Salle Sully 2 - Niv. 1

SP17 - Microbiologie des aliments

Microbiologie des aliments : y’a comme des « ...iques »

Modérateurs : Michel Federighi & Agnès Ageorges

• L’apport et les hics des approches « iques » en science des aliments : exemple du projet ANR Redlosses
  Monique Zagorec (INRAe, Nantes)

Communications orales courtes sélectionnées

• Enterobacteria and lactic acid bacteria fight during spontaneous vegetable fermentation
  Anne Thierry (UMR1253 STLO, INRAe, Rennes, France)
• Microbiome engineering as a biopreservation approach to reduce Listeria monocytogenes in food
  Frédéric Borges (LIBio, Université de Lorraine, Vandœuvre, France)
• Mango Microbiota: From the Orchard to the Plate
  Jean-Christophe Meile (UMR QUALISUD, CIRAD, Montpellier, France)

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Salle Rondelet - Niv. 2

SP18 - Environnement

Interactions microbiennes dans l’environnement (en association avec l’AFEM)

Modérateurs : Julie Leloup & Yannick Gueguen

• Évolution des interactions plantes-microorganismes et sélection artificielle de microbiotes
  Manuel Blouin (AgroSup - Université de Bourgogne, Dijon)

Communications orales courtes sélectionnées

• Top-down effects on bacterial carbon metabolism: A case study from lakes of French Massif Central
  Pradeep Ram Angia Sriram (Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE), UMR CNRS 6023, CNRS, Aubière, France)
• Pattern and causes of the establishment of the invasive bacterial potato pathogen Dickeya solani
  Denis Faure (I2BC, Univ. Paris-Saclay-CNRS-CEA, Gif-sur-Yvette, France)
• Abortive infection and defensive symbiosis - novel defense strategies against giant viruses
  Vincent Delafont (UMR CNRS Ecologie et Biologie des Interactions, Université de Poitiers, Poitiers, France)
• Seasonal monitoring reveals concomitant and rapid changes of bacterioplankton and phytoplankton communities
  Julie Leloup (iEES-Paris, Sorbonne Université, Paris, France)

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Auditorium Pasteur - Niv. 1

SP19 - Antimicrobiens

Diffusion de la résistance

Modératrices : Marie-Frédérique Lartigue & Mathilde Lescat

• Data-driven modeling to understand the evolutionary dynamics of ESBL resistance in E. coli over the last decade
  Olivier Cotto (INRAe)

Communications orales courtes sélectionnées

• Replication of the Salmonella Genomic Island 1 (SGI1) triggered by helper IncC conjugative plasmids promotes incompatibility and plasmid loss
  Kévin Huguet (Ciri -ENS Lyon, Université de Lyon 1, Villeurbanne, France)
• Interbacterial transfer of large antibiotic resistance islands by natural transformation in Acinetobacter baumannii
  Maria-Halima Laaberki (HORIGENE, VetAgro Sup/CIRI (U1111), Villeurbanne, France)
• ST38 E. coli evolution in response to the natural conjugative plasmids carrying the carbapenemase gene blaOXA 48
  Pengdbamba Dieudonné Zongo (EERA, Institut Pasteur, Paris, France)
• La D-alanylation de la surface de Clostridioides difficile permet une résistance accrue aux antibiotiques
  Pierre-Alexandre Lacotte (Equipe BaPS, Institut MICALIS, Université Paris-Saclay, Chatenay-Malabry, France)

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Salle Sully 3 - Niv. 1

SP20 - Clinique

Le flacon pour hémoculture dans tous ses états (en association avec le Col.BVH)

Modérateurs : Sophie Jarraud & Christian Cattoen

• Restitution de l’observatoire national des bactériémies
  Christian Cattoen (Centre Hospitalier, Valenciennes)
• Nouvelles approches de prise en charge rapide des bactériémies
  Brigitte Lamy (CHU, Nice)

Communications orales courtes sélectionnées

• Le flacon d’hémoculture intelligent : détection multiparamétrique des métabolites pour une identification sans a priori
  Thibaut Cohu (LETI / DTBS, Univ. Grenoble-Alpes - CEA, Grenoble, France)
• Use of peptide microarrays for the early detection of pathogens during hemoculture: validation with Staphylococcus aureus
  Loïc Leroy (SyMMES, UMR 5819, CNRS-CEA-Univ. Grenoble Alpes, Grenoble, France)

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Espace Antigone - Niv. 2SESSION POSTERS 1 - Numéros pairs

Modérateur : Olivier Dussurget

Salle Barthez - Niv. 2

SP21 - Microbiologie fondamentale / Pathogénie

Persistence and Tolerance

Chairs: Laurent Kremer & Maxime Pichon

• Intrabacterial lipid inclusions: their role in the survival and persistence of pathogenic mycobacteria
  Stéphane Canaan (LISM, CNRS, Marseille)
• TisB toxin-induced tolerance to antibiotics in Escherichia coli
  Ivan Matic (Institut Cochin, Paris)

Selected short oral presentations

• Mycobacterium tuberculosis genetic features associated with pulmonary tuberculosis severity
  Charlotte Genestet (CIRI - Centre International de Recherche en Infectiologie, Lyon, France)
• Evolution of Pseudomonas aeruginosa and its interaction with Staphylococcus aureus in Cystic Fibrosis patients
  Karen Moreau (Pathogénie des Staphylocoques, CIRI, Lyon, France)

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Salle Sully 1 - Niv. 1

SP22 - Virologie

Infections virales de l’immunodéprimé

Modérateurs : Céline Bressollette-Bodin & Jérôme Le Goff

• Apport du suivi immunologique pour le traitement des infections à CMV
  Sophie Alain (CNR Herpèsvirus CMV, CHU, Limoges)

Communications orales courtes sélectionnées

• Torquetenovirus viral load predicts SARS-CoV-2 vaccine response in kidney transplant recipients
  Morgane Solis (Laboratoire de Virologie, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France)
• Infection à adénovirus F41 et cytolyse hépatique chez des adultes greffés de cellules souches hématopoïétiques
  Maud Salmona (Virologie, Hôpital Saint-Louis APHP, Paris, France)
• A new immunosuppressed pig model to study chronic Hepatitis E infection and the genetic viral diversity
  Nancy León-Janampa (Université de Tours, INSERM U1259, Tours, France)
• Surveillance de la résistance des virus herpes simplex et du virus de la varicelle et du zona aux antiviraux sur une période de 14 ans
  David Boutolleau (Service de Virologie, Hôpital Pitié-Salpêtrière, CNR Herpèsvirus HSV, Paris, France)

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Salle Sully 2 - Niv. 1

SP23 - Microbiologie des aliments

Food, yeast and mold: the good and the bad

Chairs: Sabine Galindo & Monika Coton

• The multiple facets of food associated molds
  Monika Coton (Université de Brest, Brest)

Selected short oral presentations

• Impact of biotic and abiotic factors on the efficacy of antifungal biocides used in the dairy industry
  Emmanuel Coton (LUBEM UR 3882 USC INRAe, Université de Bretagne Occidentale, Plouzané, France)
• Contamination de pommes par Penicillium expansum et la patuline : points critiques, écosystèmes microbiens et biocontrôle par des levures
  Sabine Schorr-Galindo (UMR Qualisud, Université de Montpellier, Montpellier, France)
• Interactions entre levures œnologiques : association d’effets entre souches et espèces
  Eléonore Pourcelot (SPO, Univ Montpellier, INRAe, Institut Agro, Montpellier, France)
• Injera et Ochratoxine A : réduction du risque par des bactéries lactiques
  Christele Humblot (QualiSud, IRD, Montpellier, France)

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Salle Rondelet - Niv. 2

SP24 - Biotechnologies microbiennes

Comprendre, sélectionner et exploiter les microbiotes pour les biotechnologies environnementales

Modérateurs : Théodore Bouchez & Olivier Chapleur

• Vers une meilleure compréhension de la digestion anaérobie par une combinaison d’approches méta-omiques et biostatistiques
  Olivier Chapleur (INRAe, PROSE, Antony)

Communications orales courtes sélectionnées

• Effet de fluctuations de la concentration en ammonium sur le microbiome de laméthanisation : approche métatranscriptomique
  Patricia Bonin (UM 110 CNRS/IRD, Aix Marseille Univ., Mediterranean Institute of Oceanography (MIO), Marseille, France)
• Characterization of virus-host dynamics in anaerobic digesters under abiotic stress
  Marion Coves (PROSE, INRAe, Antony, France)
• Effet de la source de carbone et du niveau de limitation de P sur la sélection microbienne de surproducteurs de Polyhydroxybutyrate dans des cultures continues ouvertes
  Etienne Paul (Toulouse Biotechnology Institute, INSA Toulouse, Toulouse, France)
• Enrichissement de bactéries chimiolithotrophes du sol pour la fixation biologique de l’azote sur une biocathode
  Axel Rous (LBE, Univ Montpellier, INRAe, Narbonne, France)

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Auditorium Pasteur - Niv. 1

SP25 - Antimicrobiens

Lutte contre l’antibio-résistance : Stratégies innovantes de criblage et nouvelles molécules

Modérateurs : Mathilde Lescat & Jean-Maxime Devaux

• Structure-function studies and screening for efflux pumps inhibitors after their reconstitution of in biomimetic systems
  Martin Picard (CNRS / Université Paris-Diderot, Paris)

Communications orales courtes sélectionnées

• Nouvelle approche pour lutter contre les résistances bactériennes
  Miyanou Rosales-Hurtado (Institut de Biomolécules Max Mousseron, Montpellier, France)
• 1,2,4-Triazole-3-thione compounds potently inhibit VIM and NDM-1 metallo-beta-lactamases and re-sensitize multi-resistant clinical isolates to meropenem
  Jean-François Hernandez (Institut des Biomolécules Max Mousseron, Université Montpellier, CNRS, ENSCM, Montpellier, France)
• Le cluster de biosynthèse de l’antibiotique odilorhabdine et le locus d’auto-résistance codant l’acétyl-transférase OatA sont spécifiques à une niche et aux bactéries productrices
  Anne Lanois (DGIMI UMR1333 UM-INRAe, INRAe, Montpellier, France)
• Est-ce que les pharmacopées anciennes peuvent être utiles à la recherche de stratégies anti-infectieuses ?
  Pierre Fechter (UMR7242, CNRS - Université de Strasbourg, Illkirch, France)

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Salle Sully 3 - Niv. 1

SP26 - Clinique

Infections d’origine animale et environnementale

Modérateurs : Hélène Marchandin & Christophe Burucoa

• Actualités sur la Brucellose
  Jean-Philippe Lavigne (CHU de Nîmes, Nîmes)

Communications orales courtes sélectionnées

• Case presentation and management of Lyme disease patients: a retrospective analysis in France during 9 years
  Valérie Choumet (Environnement et Risques Infectieux, Institut Pasteur, Paris, France)
• Clinical and bacterial determinants of Yersinia pestis bacteremia
  Pierre Lê-Bury (Unité de Recherche Yersinia, Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR6047, Paris, France)
• La charge en ADN et en LPS sérique de Legionella et le profil cytokinique comme potentiels biomarqueurs pronostics des légionelloses
  Sophie Jarraud (CNR des Légionelles, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France)