SFM 2021

Grande Halle - Niv. 0Accueil des participants

Salle GH - Foyer Haut - Niv. 2

SP7  Microbiologie des aliments

Connaissance et maîtrise de l’altération microbiologique des aliments

Modératrices : Régine Talon et Marie-France Pilet

• L’altération microbiologique des produits de la mer : où en est-on ?
  Marie-France Pilet (INRAe Oniris - UMR SECALIM, Nantes) et
  Françoise Leroi (Ifremer, Nantes)

Communications orales courtes

• Application de l’approche PathComDim pour la modélisation des liens de causalité entre microbiote, volatilome et profils d’odeurs associés à l’altération de la viande
  Sandrine Guillou - SECALIM, INRAe, Oniris, Nantes, France
• Lactobacillus sp. et la piqure acroléique dans les cidres: nouvelles perspectives sur le métabolisme du glycérol
  Boris Misery - Normandie Univ, UNICAEN, UNIROUEN, ABTE, CAEN, France
• Quantification des cellules viables de Brochothrix thermosphacta dans le saumon fumé par une nouvelle méthode de rpoC-PMA-qPCR
  Agnès Bouju-Albert - UMR 1014 Secalim, Oniris, INRAe, Nantes, France
• Sensibilité comparée des spores bactériennes et fongiques à la lumière-pulsée et au rayonnement UV-C à 254 nm
  Imed Dorbani - UMR 408 SQPOV, INRAe, Avignon Université, Avignon, France

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Salle i - Foyer Haut - Niv. 2

SP8 - T  Anti-microbiens & résistance / Microbiologie clinique / Virologie

Modélisation - Flux de microbes et de gènes de résistance & établissements de santé
(en association avec la SF2H)

Modérateurs : Didier Lepelletier et Agathe Capitaine

• Modélisation de la transmission intra-hospitalière des entérocoques résistants aux glycopeptides selon différentes mesures barrières
  Stéphanie Deboscker (SF2H), (Hôpitaux universitaires de Strasbourg, Strasbourg)
• Infections nosocomiales en établissement de santé : gare aux virus
  Sylvie Pillet (SFM), (CHU, Saint-Étienne)

Communications orales courtes

• Suivi d’une épidémie de Klebsiella pneumoniae NDM-1 : de l’épidémiologie à l’analyse génétique
  Sylvain Meyer - Service de Bactériologie-Virologie-Hygiène, CHU Limoges, Limoges, France
• Outbreak of linezolid-resistant S. aureus/CoNS in a French hospital: evidence of clonal spread and interspecies transfer of cfr-positive plasmid
  Frédéric Laurent - Hospices Civils de Lyon, Institut des Agents Infectieux, Department of Bacteriology, French National Reference Centre for Staphylococci, Lyon, France
• De la comparaison d’antibiogrammes à la modélisation évolutive pour détecter une transmission bactérienne entre patients
  Florian Peron - CIRI, INSERM, CNRS, ENS Lyon, Université de Lyon, Lyon, France

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Salle J - Foyer Haut - Niv. 4

SP9  Mycologie

Mécanismes pathogéniques des agents de mycoses humaines (en association avec la SFMM)

Modérateurs : Jean-Philippe Bouchara et Jean-Pierre Gangneux

• Dermatophytes zoonotiques : de l'expression clinique aux mécanismes pathogéniques
  Jacques Guillot (Oniris, ENV, Nantes)
• Candida albicans et le franchissement de la barrière intestinale
  Frédéric Dalle (SFMM), (CHU, Dijon)

Communications orales courtes

• Étude du rôle physiologique des structures amyloïdes chez la levure pathogène Candida albicans
  Thierry Mourer - Département de mycologie, Institut Pasteur, Paris, France
• Algorithme de prise en charge des teignes de l’enfant après l’arrêt de la commercialisation de la griséofulvine en France
  Jean-Pierre Gangneux - Parasitologie-Mycologie, CHU de Rennes, Univ. Rennes, Inserm, Institut de recherche en santé, environnement et travail - UMR_S 1085, Rennes, France

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Auditorium 450 - Foyer Haut - Niv. 2

SP10  Pathogénie

Interactions moléculaires hôtes/pathogènes

Modérateurs : Eric Oswald et Sophie Jarraud

• Les lipides produits par le microbiote : acteurs clés de l’homéostasie intestinale
  Nicolas Cenac (Inserm, Toulouse)

Communications orales courtes

• The cytotoxic necrotizing factor 1 hinders the tumorogenesis induced by colibactin-producing Escherichia coli in ApcMin/+ mice
  Héloïse Chat - M2ISH UMR INSERM 1071, Université Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand, France
• Étude du rôle protecteur de CFTR dans la résistance innée à Staphylococcus aureus
  Audrey Bernut - UMR 1173, Infection & inflammation, INSERM/UVSQ, Montigny-le-Bretonneux, France
• Role of innate intraepithelial lymphocytes in the immune protection against Cryptosporidium
  Fatima Hariss - U1286 - INFINITE - Institute for Translational Research in Inflammation, Univ. Lille, Inserm, CHU Lille, Lille, France
• Identification of a novel nucleomodulin, LegK4 from Legionella pneumophila, and its metaeffector
  Margaux Pillon - CIRI, Inserm U1111, Université Lyon 1, Villeurbanne, France

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Club Atlantique - Niv. 2

SP11 - T  Anti-microbiens & résistance / Microbiologie clinique

Nouvelles recommandations pour l’antibiogramme : actualités et retours d’expérience
(en association avec le Col.BVH)

Modérateurs : Gérard Lina et Marie-Frédérique Lartigue

• CA SFM 2021, l’année des grands changements
  Frederic Schramm (Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg)
• Retour d’expériences du réseau du Col.BVH sur les nouvelles recommandations
  Christian Cattoen (Centre Hospitalier, Valenciennes)

Communication orale courte

• Catégorisation « Sensible à Forte Posologie (SFP) » : importance de la communication pour le choix thérapeutique
  Aurélie Beaudron - Microbiologie, CH Le Mans, Le Mans, France

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Salle KL - Foyer Haut - Niv. 4

SP12  Environnement

Explorer la diversité microbienne environnementale : nouvelles perspectives ?

Chairs: Théodore Bouchez and Yann Héchard

• Communautés microbiennes des stations d’épuration : de l’écologie moléculaire à l’écologie fonctionnelle
  Emilie Muller (CNRS, Strasbourg)

Short oral presentations

• A novel network-based approach for deep probing of microbial dark matter in metagenomic samples
  Duncan Sussfeld - UMR 7205 Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité (ISYEB), Sorbonne Université, CNRS, MNHN, EPHE, Université des Antilles, Paris, France
• Microbial diversity as a barrier to ARG invasion in the environment
  Elisa Catão - LCPME, Université de Lorraine, CNRS, Nancy, France
• Les phoques : une source potentielle de contamination fécale bactérienne et virale du littoral ?
  Michèle Gourmelon - DYNECO/PELAGOS, IFREMER, Plouzané, France
• Occurrence et dissemination des e. coli STEC dans les eaux de surface exemple de la Moselle et de l’Orne
  Stéphanie Etienne - LHN Microbiologie des eaux, ANSES, Nancy, France

Salle GH - Foyer Haut - Niv. 2

SP13  Microbiologie des aliments

Sécurité microbiologique de la chaîne alimentaire

Modérateurs : Michel Federighi et Pauline Kooh

• TIAC & coupables : retour aux sources… d’attribution !
  Pauline Kooh (ANSES, Maisons-Alfort)

Communications orales courtes

• Physiologie d’un Escherichia coli O157:H7 au cours de la digestion gastrique d’une viande hachée de bœuf
  Sabine Leroy - MEDIS, UCA, INRAE, Clermont-Ferrand, France
• Détection et caractérisation de souches de Clostridioides difficile d’origines alimentaires et animales en France
  Olivier Firmesse - Laboratoire de Sécurité des Aliments, Anses, Maisons-Alfort, France
• Réponses moléculaires du pathogène Campylobacter jejuni aux stress inspirés du procédé d’abattage du poulet
  Nabila Haddad - UMR INRAe SECALIM, ONIRIS, Nantes, France
• Quels sont les impacts de conditions abiotiques sur la croissance cellulaire de deux pathogènes alimentaires Listeria monocytogenes et Escherichia coli 0157:H7 ?
  Valérie Stahl - Aerial ITAI, Illkirch, France

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Auditorium 450 - Foyer Haut - Niv. 2

SP14 - T  Environnement / Microbiologie clinique

Biofilm : une session qui va vous coller !

Modérateurs : Brigitte Lamy et Jean-Marc Ghigo

• Évolution expérimentale de la formation de biofilm chez Escherichia coli
  Jean-Marc Ghigo (Institut Pasteur, Paris)

Communications orales courtes

• Staphylococcus aureus biofilm formation in response to bone factors
  Fabien Lamret - EA 4691 BIOS, Université de Reims Champagne-Ardenne, Reims, France
• Composition et contribution de la couche S aux propriétés de surface de Bacillus cereus AH187
  Cécile Boutonnet - UMR 408 SQPOV (INRAE), Université Avignon, Avignon, France
• Le mode de vie en biofilm renforce les activités probiotiques des lactobacilles
  Aurélie Rieu - UMR PAM, Université de Bourgogne, Dijon, France
• Spatial organization of food pathogens Listeria monocytogenes and Escherichia coli in jellified media
  Cédric Saint Martin - MICALIS, INRAe, Jouy-en-Josas, France

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Salle J - Foyer Haut - Niv. 4

SP15  Mycologie

Plasticité génomique et fonctionnelle

Modérateurs : Marie-Noëlle Rosso et Théo Ghelfenstein-Ferreira

• Dynamique et plasticité du transcriptome de Cryptococcus
  Guilhem Janbon (Institut Pasteur, Paris)
• Mining the fungal biodiversity for novel bioactive compounds
  Jerome Collemare (Westerdijik Fungal Biodiversity Institute, Utrecht, Netherlands)

Communications orales courtes

• La phylosystémique : annotation phylogénétique et comparaison des réseaux d’interactions biologiques dans une perspective évolutive
  Hugo Bonnefous - ISYEB (MNHN), Paris, France
• Tester la pression de sélection à l’échelle du gène en prenant en compte l’effet des mutations
  Lucile Vigué - UMR 1137, IAME, Université de Paris, INSERM, Paris, France

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Salle i - Foyer Haut - Niv. 2

SP16 - T  Pathogénie / Mycologie

Pathogénie comparée (plantes, animaux, être humain) (en association avec la SFMM)

Modérateurs : Alain Sarniguet et Sarah Dellière

• Adaptation et pathogénie de Xanthomonas dans sa niche végétale
  Laurent Noël (CNRS, Castanet-Tolosan)
• Mécanismes de pathogénie chez Alternaria brassicicola, champignon nécrotrophe pathogène des Brassicacées
  Philippe Simoneau (Université d’Angers, Angers)

Communications orales courtes

• Transposable elements mediate a rapid phenotypic switch between virulent and avirulent states in the fish pathogen Flavobacterium psychrophilum
  Bo-Hyung Lee - VIM, INRAe, Jouy-en-Josas, France
• Rôle de l’antigène O dans la reconnaissance d’Escherichia coli par le système immunitaire innée et adaptatif des bovins
  Pierre Germon - INRAe, Nouzilly, France

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Club Atlantique - Niv. 2

SP17  Anti-microbiens & résistance

Optimisation des anti-microbiens

Modérateur : Maxime Pichon

• Optimisation de l’utilisation des anti-microbiens : faire plus ou faire mieux ?
  Julien Buyck (Université de Poitiers, Poitiers)

Communications orales courtes

• NAD kinase: an original bacterial target for antibiotic development
  Clarisse Leseigneur - Unité de Recherche Yersinia, Institut Pasteur, Paris, France
• Innovative antimicrobial strategy based on Targeted-Antibacterial-Plasmids (TAPs) combining bacterial conjugation and CRISPR systems
  Sarah Bigot - MMSB-UMR5086, CNRS-Université Lyon, Lyon, France
• An expected antibacterial property of decellularized Wharton’s jelly derived matrix: an innovative matrix for tissue engineering
  Marie Dubus - EA4691 BIOS, Université de Reims Champagne-Ardenne, Laboratoire BIOS, Reims, France
• Activité antibactérienne d’extraits issus de macromycètes méditerranéens sur une collection de souches cliniques à Gram positif
  Alessandra Occhialini - IRIM, Institut de Recherche en Infectiologie de Montpellier, UMR9004, Université de Montpellier et CNRS, Montpellier, France

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Salle KL - Foyer Haut - Niv. 4

SP18  Virologie

Génomique et transcriptomique, de nouvelles approches en virologie

Modérateurs : Sonia Burrel et Gaëtan Ligat

• Acquisition de la résistance aux antiviraux chez les virus herpes simplex
  David Boutolleau (AP-HP. Sorbonne Université, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Paris)

Communications orales courtes

• Génétique des sous-populations virales intra tissulaires au cours des néphropathies associées au polyomavirus BK après transplantation rénale
  Louise Manceau - Laboratoire de Virolgie, CHU Nantes, Nantes, France
• Étude transcriptomique hôte/virus comparative dans le cas des infections génitales par les virus herpes simplex 1 (HSV-1) et 2 (HSV-2)
  Sonia Burrel - AP-HP. Sorbonne Université GHU Pitié-Salpêtrière, Inserm UMR_S 1136 équipe THERAVIR - iPLESP, Paris, France
• Analyse métagénomique shotgun de liquides broncho-alvéolaires après transplantation pulmonaire
  Sarah Marchand - Laboratoire de Virologie, CHU Nantes, Nantes, France