Lundi 4 juin
Cytométrie appliquée à la microbiologie
Intervenants : Marielle Bouix (AgroParisTech), Pierre Burguiere (AMA-RS)
09:15-09:45
Espace AtriumArrivée & Bienvenue
Amphithéâtre ABases de la cytométrie en microbiologie (Présentation théorique)
09:45-10:15
Principe de la cytométrie en flux Applications, contraintes et intérêts en microbiologie
10:15-11:15
Dénombrement des microorganismes
- Dénombrement des cellules totales sans marquage
- Dénombrement des cellules viables (cFDA) : principe, méthode
- Dénombrement des cellules mortes (IP) : principe, méthode
- Dénombrement simultané cellules viables & mortes (cFDA/IP, SYTO9/IP) : principe, méthode
11:15-11:45
Espace AtriumPause café
11:45-12:45
Applications
- Préparation spécifique d’échantillon
- Dénombrement des levures : jus de fruit, vin, yaourt
- Dénombrement des LAB : ferment (norme ISO)
- Dénombrement en mout industriel non alimentaire
12:45-14:00
Espace AtriumDéjeuner
Amphithéâtre ACytométrie avancée : détection spécifique et fonctionnalités
(Présentation théorique)
14:00-15:30
Détection spécifique
- FISH : principe, avantages & inconvénients, exemple
(1 : contaminant présence/absence - 2 : microbiote & abondance) - Anticorps : principe, avantages & inconvénients, exemple, couplage viabilité/spécificité
- GFP
15:30-16:00
Espace AtriumPause café
16:00-17:30
Physiologie et Fonctionnalités microbiennes
- Intérêt de l’évaluation de fonctionnalités cellulaires
- Vitalité
- Potentiel membranaire
- Fluidité membranaire
- pH intracellulaire